Չինաստանի և Գերմանիայի գիտնականներն առաջին անգամ ամբողջությամբ վերծանել են կարտոֆիլի գենոմը, հայտնում է ՏԱՍՍ-ը։ Սա օգնեց նրանց բացահայտել այս բույսի էվոլյուցիոն պատմությունը և ընդգծել ԴՆԹ-ի հիմնական հատվածները, որոնք կապված են աճի և հիվանդությունների դիմադրության հետ: Այս մասին տեղեկություն է հրապարակել Բուսաբուծության գերմանական ինստիտուտի (IPZ) մամուլի ծառայությունը։
«Կարտոֆիլի գենոմի հաջորդականությունը թույլ կտա մեզ սկսել բուծման բարձր արդյունավետության ծրագրեր, որոնք կստեղծեն նոր սորտեր, որոնք բարձր բերքատվություն ունեն, բայց դիմացկուն են գլոբալ տաքացմանը, ինչը կարևոր կլինի առաջիկա տասնամյակների ընթացքում», - ասում է IPZ-ի պրոֆեսոր Կորբինյան Շնեբերգերը:
Շատ սնկային և բակտերիալ հիվանդություններ խանգարում են կարտոֆիլի մշակմանը, ինչպես նաև տարբեր վնասատուների, ինչպիսիք են Կոլորադոյի կարտոֆիլի բզեզը և նեմատոդները: Գիտնականներն ու բուծողները փորձում են պայքարել դրանց դեմ՝ ստեղծելով սովորական և գենետիկորեն ձևափոխված կարտոֆիլի նոր տեսակներ:
Պրոֆեսոր Շնեբերգերը և նրա գործընկերները այս խնդրի պոտենցիալ լուծում են գտել հսկայական նախագծում, որն ուղղված է կարտոֆիլի գենոմի ամբողջական հաջորդականացմանը: Նախկինում գիտնականներն արդեն փորձել են ստանալ այս տեղեկատվությունը, բայց դրան խանգարել է կարտոֆիլի գենոմի չափազանց բարդ կառուցվածքը. այն բաղկացած է քրոմոսոմների չորս նույնական խմբերից, որոնք պարունակում են մեծ թվով կրկնություններ:
ԴՆԹ-ի հաջորդականության նոր տեխնոլոգիաները և գենետիկական տեղեկատվության վերլուծության ալգորիթմները օգնեցին գերմանացի և չինացի գենետիկներին լուծել այս խնդիրը Otava սորտի համար: Գենոմը վերծանելու համար գիտնականները հավաքել են մեծ քանակությամբ փոշու հատիկներ, որոնց գենետիկ նյութը պարունակում է քրոմոսոմների միայն երկու, այլ ոչ թե չորս օրինակ։
Այս մոտեցումը մեծապես պարզեցրեց առաջադրանքը, բայց միևնույն ժամանակ պահանջեց շատ մեծ թվով ԴՆԹ-ի բեկորների վերծանում և դրանց հետագա համադրություն համակարգչային ալգորիթմների միջոցով: Ի վերջո, գիտնականները ստացել են կարտոֆիլի ամբողջական գենոմի վիրտուալ պատճենը, որը բաղկացած է մոտավորապես 3,1 միլիարդ գենետիկ «տառերից»՝ նուկլեոտիդներից և պարունակում է ավելի քան 38 գեն:
Նրանց կառուցվածքի հետագա վերլուծությունը բացահայտեց կարտոֆիլի բարդ էվոլյուցիոն պատմությունը: Գիտնականները պարզել են, որ այս մշակույթը համեմատաբար վերջերս է վերապրել գենոմի կրկնապատկումը՝ ինբրիդավորման արդյունքում։ Բացի այդ, գիտնականները հայտնաբերել են տարբեր քրոմոսոմների վրա տեղակայված նույն գեների կրկնօրինակների ակտիվության մակարդակի անսովոր տարբերություններ, որոնք կարող են ազդել կարտոֆիլի տարբեր տեսակների հատման արդյունավետության վրա:
Գիտնականները հուսով են, որ այս տեղեկատվությունը կօգնի նոր սորտերի բուծմանը կամ գենոմի ձևափոխմանն այնպես, որ կարտոֆիլն ավելի արագ աճի, ավելի լավ դիմադրի ուշացած աղիքներին և այլ հիվանդություններին, ինչպես նաև ավելի քիչ ենթակա լինի տարբեր սթրեսային գործոններին: